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使用Kimi进行英文医学文献的阅读:

时间:2024-10-30 14:30 分类:站在黑暗里的英雄

使用Kimi进行英文医学文献的阅读:

原文:MATERIALS AND METHODS

Protein expression and puriffcation

Full-length ORFs of Nme1Cas9 (encoding residues 1–

1082), Nme2Cas9 (encoding residues 1–1082), SmuCas9

(encoding residues 1–1063) and AcrIIC5 (encoding residues

1–130) were synthesized from Sangon Biotech and cloned

into an expression vector pET28a-Sumo with a N-terminal

His6-Sumo tag. The codons of these genes are optimized

according to Escherichia coli. Mutants were constructed using

a site-directed mutagenesis kit. All proteins were overexpressed

in E. coli BL21 (DE3) (Novagen) cells and were induced

with 0.2 mM isopropyl--D-1-thiogalactopyranoside

(IPTG) at OD600 = 0.8 at 18C for 12 h.

Cells expressing Cas9 were harvested and then disrupted

by sonication in lysis buffer containing 20 mM Tris–HCl

(pH 7.5) and 0.5 M NaCl at 4C following high-speed

centrifugation. The supernatant was incubated with Ni

2+-

Sepharose resin (GE Healthcare), and the bound protein

was eluted with lysis buffer supplemented with 200 mM imidazole.

The eluted protein was incubated with His-tagged

ubiquitin-like protein 1 (Ulp1) protease to remove the His6–

Sumo-tag, and dialyzed against buffer containing 20 mM

Tris–HCl (pH 7.5), 250 mM NaCl at 4C for 2 h. Cas9 proteins

were further puriffed by chromatography on Ni-NTA

and SP column (GE Healthcare).

Cells expressing AcrIIC5 were disrupted by sonication

in lysis buffer containing 20 mM Tris–HCl (pH 7.5) and

0.5 M NaCl at 4C. After high-speed centrifugation, the

supernatant was incubated with Ni

2+-Sepharose resin (GE

Healthcare), and the bound protein was eluted with lysis

buffer supplemented with 250 mM imidazole. His6-Sumo

tag was cleaved from AcrIIC5 protein by His-tagged Ulp1

protease during dialysis against buffer containing 20 mM

Tris–HCl (pH 7.5), 200 mM NaCl for 2 h at 4C and

removed by a second Ni

2+-Sepharose column. The ffowthrough

collections were loaded into a Q column (GE

Healthcare) equilibrated by buffer containing 20 mM Tris–

HCl (pH 7.5), 200 mM NaCl, eluting with buffer containing

20 mM Tris–HCl (pH 7.5), 1 M Na

Kimi:

这部分内容描述了在研究中使用的材料和方法,涉及Nme1Cas9、Nme2Cas9、SmuCas9和AcrIIC5等蛋白质的表达和纯化过程。以下是该过程的详细分解:

1. **蛋白质表达**:

- 将这些蛋白质的完整开放阅读框架(ORFs)合成并克隆到带有N端His6-Sumo标签的表达载体pET28a-Sumo中,用于后续的纯化步骤。

- 根据大肠杆菌的表达特性对这些基因的密码子进行优化。

- 使用定点突变试剂盒构建蛋白质突变体。

- 在大肠杆菌BL21 (DE3)细胞中进行蛋白质的过度表达,使用0.2 mM异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)在18°C下诱导表达12小时。

2. **蛋白质纯化**:

- 对于Cas9蛋白质:

- 收集表达Cas9的细胞,通过超声破碎法在裂解缓冲液中破碎细胞。

- 将上清液与Ni2+-Sepharose树脂孵育以结合带有His6-Sumo标签的蛋白质。

- 使用含有200 mM咪唑的裂解缓冲液洗脱结合的蛋白质。

- 用His标签的Ulp1蛋白酶处理洗脱的蛋白质以去除His6-Sumo标签。

- 将蛋白质透析并进一步通过Ni-NTA和SP柱层析进行纯化。

- 对于AcrIIC5:

- 收集表达AcrIIC5的细胞,通过超声破碎法在裂解缓冲液中破碎细胞。

- 将上清液与Ni2+-Sepharose树脂孵育以结合带有His6-Sumo标签的蛋白质。

- 使用含有250 mM咪唑的裂解缓冲液洗脱结合的蛋白质。

- 在透析过程中,用His标签的Ulp1蛋白酶切割去除His6-Sumo标签。

- 将流穿部分(含有未标记的AcrIIC5)加载到Q柱上进行进一步纯化。

这种方法确保了蛋白质以受控的方式表达,并可以纯化到均一性,用于后续的研究,如结构分析或功能测定。使用特定的缓冲液和层析技术可以去除不需要的细胞组分和标签,从而获得用于进一步研究的纯净蛋白质样品。

感想:

不可否认这种学习方法效率确实非常高

Kimi 不仅仅能够翻译

而且翻译出来的文字他还能够进行总结

对对于总结出来的文字还可以使用不同的口气

根据不同的对象、根据不同的场合、使用特定的表达方式

进行重新表达

比如说:

对一群小学生进行科普

在一个学术会议上进行交流

把这段文字整理成ppt

或者把这段文字整理成一个思维导图

这些需求 Kimi 都是可以轻松做到的

这样就能够非常方便而且高效的协助学习。

可以说以后人工智能的应用

或者是说如何善于利用人工智能

或者说如何把网络搜索和人工智能

一起结合起来进行学习也许就是一个将来很核心的一种能力。

3.

向Kimi提交需求:对象是小学生,进行有趣的科普

Kimi的回复:

好的,让我们用一个有趣的故事来向小学生科普这个过程:

---

**故事标题**:小小科学家的蛋白质冒险

**故事内容**:

在一个遥远的实验室王国里,住着四个好朋友:Nme1Cas9、Nme2Cas9、SmuCas9和AcrIIC5。他们是一群特殊的蛋白质小精灵,每个人都有自己的魔法力量。

有一天,他们收到了一个任务:要帮助实验室的科学家们研究如何让世界变得更美好。但是,他们需要先通过一系列的挑战,才能发挥他们的魔法力量。

首先,他们来到了一个叫做“基因表达站”的地方。在这里,他们需要找到一种方法让自己变得更强大。科学家们用一种魔法(合成完整的ORFs)帮助他们,还给他们穿上了一件神奇的斗篷(His6-Sumo标签),这样他们就能更容易地被找到和使用。

接下来,他们来到了“细胞工厂”,这里有很多勤劳的小工人们(大肠杆菌)。蛋白质小精灵们在这里学习如何变得更强大,他们跟着小工人们一起唱歌跳舞(过度表达),并且变得越来越多。

但是,他们还需要变得更特别。于是,他们来到了“变形站”,在这里,他们通过学习和成长(突变体构建)来变得更强大。

最后,他们来到了“纯化湖”。湖水里有神奇的水晶(Ni2+-Sepharose树脂),能够识别并吸引穿着神奇斗篷的小精灵们。小精灵们跳进湖水,水晶紧紧地抓住他们。然后,科学家们用一种特殊的魔法(洗脱)让小精灵们脱下斗篷,这样他们就可以自由地在湖水中游泳了。

经过一系列的挑战,蛋白质小精灵们终于准备好了,他们可以用自己的魔法力量帮助科学家们研究如何让世界变得更美好。

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这个故事以寓教于乐的方式,向小学生介绍了蛋白质的表达和纯化过程。通过将科学概念融入到一个有趣的故事中,孩子们可以更容易地理解和记住这些概念。

更新于:2天前